睢宁地处淮楚平原苏皖交界处。疆域纵横百里，襟山带河，腹部平6原，川原交错。北部、西部边缘是连绵数里的青山。青山脚下，百里黄河故道，如一条银色的宽带曲折、蜿蜒，缓缓东流。河村山色，水映田畴，实是山河壮丽之境。因此，早在远古时期，在其西北及西部山区地带就有人类聚族而居。
夏：仲康三年，地属邳国。奚仲居薛，为夏车正，后迁于邳。世子相，居商丘，来依邳侯。
商：外壬元年及河禀甲三年，北境属邳国，南境属蒲如国。《左传》：昭公九年，赵孟曰：商有先邳。《路史》：蒲如，商时国名，不久取消。
周：公元前1046年，睢宁辖境（下同）的北部属下邳国、南部属取虑（音：秋闾，）国（治所在今安徽省灵璧县潼郡村）,境内有泗水、沂水（大沂水、小沂水）、睢水（小河），蒲隧。
秦：公元前221年，改国为县。南为取虑县，北为下邳县，属青州。
汉：武帝元光年间（公元前134～前128年），在取虑东置“睢陵”。元狩元年（公元前122年）置临淮郡，辖睢陵县。境内有蒲姑陂。
王莽时（公元9～14年），将睢陵改为睢陆。汉光帝时（公元25～26年），复为睢陵县。东汉，睢陵、取虑属下邳国。睢陵、取虑并存。属下邳国。
三国：公元220年，睢陵县、取虑属魏，下邳郡。
晋：公元205年，西晋时，睢陵、取虑属下邳国。武帝太康二年（公元281年）在睢宁地区置陵县，后改为北陵县。
东晋时（公元317年），定陶县在睢宁地侨置定陶县，属济阴郡。南朝.齐永明元年（公元483年）废。
南北朝：南朝·宋（公元420～479年），在睢陵治置济阴治。
南朝·齐（公元479～502年）在今安徽省明光东北部侨置睢陵县，后改为化明县、招义县、昭义县、招信县。
南朝·梁（公元502～557年）取虑为潼州治。
东魏：孝静帝五年（公元547年），睢陵属东魏徐州彭城郡；六年，置睢陵县。晋陵县、取虑县属临淮郡；又置睢陵县，属临潼郡（后改为潼郡）。
隋：文帝开皇初年（公元581年后），睢陵县制撤销，睢地北入下邳，南入泗州。
唐、宋：睢地无建置。
金：金兵南下，占睢地。此时，睢地为宿迁县辖。宣宗兴定二年（公元1218年）在 宿迁“古城”置睢宁治，建睢宁县（自此，睢宁县名及治所历经元、明、清未变），属南京路泗州。金亡（公元1234年），睢地复归宋。
元：元初，睢宁民少，撤销建置归邳州。世祖至元十二年（公元1275年），复置睢宁县属淮安府。十五年属归德府邳州。
时县境：东到沙集、凌城，南到邱集，西南至李集，西到桃园、高楼、大王庙，北到黄河古道。辖20个社，即坊廊、水南、岗头、仔仙、宋家山、伍分、辛兴、湖山、高岗、余家渡、高作、凌城、瓜娄、芹沟、池山、竹城、师村、泥沟、李家庄、靳家滩。
明：睢宁属淮安府邳州。实行县、乡、社制。太祖洪武十四年（公元1381年），将邳州地区的木社、辛安、马浅等14个社划入睢宁。全县有4个乡34个社。
清：顺治元年（公元1644年），睢宁属江南省淮安府。清初至光绪十二年（公元1886年），睢宁县行政区划承袭明制，计4个乡34个社。宣统年间（公元1909年后），改社为“寨”、“集”。计4个乡、12个镇，81个寨、7个集。属江苏省徐州府。
民国： 民国建立后，睢宁县直属江苏省政府。民国三年（公元1914年），隶属徐海道。民国十年，经临时县议会决议，全县设4市13乡。
民国十六年（公元1927年），直属江苏省政府。民国二十四年（公元1935年），属省第九督察行政区。民国二十七年（公元1938年），日军侵占睢宁，伪县政府占据县城。先属伪江苏省政府，后属伪淮海省政府。民国县政府在县边境地区活动。中共的邳睢县、铜睢县、泗宿县、泗灵睢县等抗日民主政府在县境南北地区与人民一起抗日斗顽。建县时间长短不一，辖区变化大，常交叉管理。民国三十四年七月（公元1945年），伪县政府被消灭，中共领导的县民主政府建立，属中共华中七行署。民国县政府流亡安徽、徐州等地。民国三十五年九月（公元1946年），民国县政府重返睢宁县。
民国三十七年十一月（公元1948年），民国县政府被中共领导的武装推翻，建立民主县政府。时有1个市政府、12个区公所、130个乡政府。
新中国：
公元1950年，建立县人民政府，至今未变。
公元1953年，撤销邳睢县，将其所属双沟、张圩、古邳、张集划入睢宁县，先属淮阴公署，后属徐州公署。
公元1983年，属徐州市。
公元1950～1953年，睢宁县东北部的皂河镇、苗圩乡、九城乡等九个乡镇划归宿迁县。睢宁西北部的灵璧、大王庙、高楼划归灵璧县。灵璧县的陈集、鲁庙、柴湖等地划归睢宁县。到1956年，睢宁县境基本稳定，至2020年，辖区未变。
公元2020年，辖桃园、李集、官山、邱集、凌城、沙集、高作、梁集、魏集、古邳、姚集、庆安、王集、双沟、岚山等十五个镇及睢城、睢河、金城三个街道。